Estudo teórico do mecanismo catalítico da enzima Piruvato Formato Liase

Abstract

A conversão de piruvato e CoA em acetil-CoA e formato, catalisada pela enzima piruvato formato liase (PFL), ocorre em duas etapas. A primeira dessas etapas foi estudada no âmbito deste trabalho.Dado o tamanho do sistema em causa, foram usados modelos que constituem apenas uma pequena parcela da enzima. Efectuou-se também uma comparação crítica relativamente ao uso do substrato (piruvato) na forma neutra ou carregada, de modo a estabelecer o que reproduz de forma mais adequada o comportamento do sistema. O mecanismo catalítico desta enzima foi estudado utilizando um formalismo quântico designado teoria do funcional de densidade (DFT).Os resultados obtidos permitem apresentar um mecanismo compatível com os dados experimentais. Um dado importante emergente deste trabalho diz respeito à inexistência de um intermediário tetraédrico, para a adição de uma cisteína radicalar ao piruvato previsto em mecanismos apoiados em trabalho experimental. Os cálculos efectuados revelam apenas a existência de um estado de transição, para o passo em questão, o que pode justificar o facto de o intermediário nunca ter sido detectado.