Chromosome 6q deletions in gastric carcinoma : A Positional cloning approach to isolate cDNAs at 6q16.3-q23.3 = Delecções do braço longo do cromossoma 6 em carcinomas gástricos : Isolamento de cDNAs em 6q16.3-q23.3 por clonagem posicional

Abstract

O cromossoma 6 é um dos cromossomas mais frequentemente envolvido em alterações estruturais em tumores gástricos. De todas as anomalias descritas deste cromossoma, a delecção parcial do braço longo representa é a alteração mais vezes detectada, tanto por análise citogenética como por estudos de perda de heterozigotia (LOH).A perda de heterozigotia em 6q ocorre em todos os tipos histológicos de carcinoma gástrico, incluindo tumores precoces.O objectivo "major" deste estudo foi isolar genes localizados em 6q que podem estar envolvidos no desenvolvimento e progressão de tumores gástricos. Em estudos anteriormente realizados pelo nosso grupo, foram definidas duas regiões de delecção mínima uma intersticial em 6q16.3-q23.1 (15 cM) e uma distal em 6q27 (> 30 cM). No entanto, como a extensão destas duas regiões não permitia ainda o início de pesquisa de genes, o nosso primeiro objectivo foi delimitar a região intersticial. Para isso, foram seleccionados novos marcadores localizados na região (marcadores microssatélites), que viriam a ser aplicados na análise de um painel alargado de tumores primários. Do mapeamento detalhado da região foi possível restringir a região intersticial de 15 cM para uma nova região de apenas 2 cM (aproximadamente 3 Mb) (Artigo I).No sentido de ultrapassar os problemas de análise e interpretação decorrentes da contaminação estromal em tumores primários, procedemos ao estudo de tumores xenografados em ratinhos atímicos e linhas celulares derivadas dos xenografos, estabelecidos no nosso Instituto. Este estudo, envolvendo análise de microssatélites e FISH, permitia verificar se as linhas celulares em causa apresentavam as mesmas alterações em 6q detectadas nos tumores primários, o que, a verificar-se, permitiria utilizar este material como para estudos futuros, nomeadamente estudos funcionais.Verificámos que, tal como nos tumores primários, duas linhas celulares apresentavam uma delecção distal (6q27). Estes resultados apoiam a existência d ...