Browsing by Author Nuno F. Azevedo

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2014A new colorimetric peptide nucleic acid-based assay for the specific detection of bacteriaCarina Almeida; Diogo Constante; André Ferreira; Laura Cerqueira; Maria J. Vieira; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2018Agent-based model of diffusion of N-acyl homoserine lactones in a multicellular environment of Pseudomonas aeruginosa and Candida albicansGael Pérez-Rodríguez; Sónia Dias; Martin Pérez-Pérez; Florentino Fdez-Riverola; Nuno F. Azevedo; Anália LourençoArtigo em Revista Científica Internacional
2015Agent-Based Spatiotemporal Simulation of Biomolecular Systems within the Open Source MASON FrameworkGael Pérez Rodríguez; Martín Pérez Pérez; Daniel Glez Peña; Florentino Fdez Riverola; Nuno F. Azevedo; Anália LourencoArtigo em Revista Científica Internacional
2014An harmonised vocabulary for communicating and interchanging biofilms experimental resultsAna Margarida Sousa; Maria Olívia Pereira; Nuno F. Azevedo; Anália LourençoArtigo em Revista Científica Internacional
2017-02-15An in vitro model of catheter-associated urinary tract infections to investigate the role of uncommon bacteria on the Escherichia coli microbial consortiumAndreia S. Azevedo; Carina Almeida; Luciana C. Gomes; Filipe J. Mergulhão; Luís F. Melo; Nuno F. Azevedo; Carla FerreiraArtigo em Revista Científica Internacional
2019Application of agent-based modelling to assess single-molecule transport across the cell envelope of E. coliPaulo Maia; Gael Pérez-Rodríguez; Martín Pérez-Pérez; Florentino Fdez-Riverola; Anália Lourenço; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2012BiofOmics: A Web Platform for the Systematic and Standardized Collection of High-Throughput Biofilm DataAnália Lourenço; Andreia Ferreira; Nuno Veiga; Idalina Machado; Maria Olivia Pereira; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2012Computational approaches to standard-compliant biofilm data for reliable analysis and integrationAna Margarida Sousa; Andreia Ferreira; Nuno F. Azevedo; Maria Olívia Pereira; Anália LourençoArtigo em Revista Científica Internacional
2016Computational resources and strategies to construct single-molecule metabolic models of microbial cellsDenise Gameiro; Martín Pérez-Pérez; Gael Pérez-Rodríguez; Gonçalo Monteiro; Nuno F. Azevedo; Anália LourençoArtigo em Revista Científica Internacional
2017Critical review on biofilm methodsJoana Azeredo; Nuno F. Azevedo; Romain Briandet; Nuno Cerca; Tom Coenye; Ana Rita Costa; Michaël Desvaux; Giovanni Di Bonaventura; Michel Hébraud; Zoran Jaglic; Miroslava Kacániová; Susanne Knochel; Anália Lourenço; Filipe Mergulhão; Rikke Louise Meyer; George Nychas; Manuel Simões; Odile Tresse; Claus SternbergArtigo em Revista Científica Internacional
2015Detection and discrimination of biofilm populations using locked nucleic acid/2 '-O-methyl-RNA fluorescence in situ hybridization (LNA/2 ' OMe-FISH)Andreia S. Azevedo; Carina Almeida; Bruno Pereira; Pedro Madureira; Jesper Wengel; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2014Detection of Dehalococcoides spp. by peptide nucleic acid fluorescent in situ hybridizationAnthony Steven Danko; Sílvia Fontenete; Daniel de Aquino Leite; Patrícia O. Leitão; Carina Almeida; Charles E. Schaefer; Simon Vainberg; Robert J. Steffan; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2019Development and application of Peptide Nucleic Acid Fluorescence in situ Hybridization for the specific detection of Listeria monocytogenesRui Rocha; José M. Sousa; Laura Cerqueira; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2017Discriminating Typical and Atypical Cystic Fibrosis-Related Bacteria by Multiplex PNA-FISHSusana P. Lopes; Daniel T. Carvalho; Maria O. Pereira; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2016Discrimination of bacteriophage infected cells using locked nucleic acid fluorescent in situ hybridization (LNA-FISH)Diana Vilas Boas; Carina Almeida; Sanna Sillankorva; Ana Nicolau; Joana Azeredo; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2015Effect of Native Gastric Mucus on in vivo Hybridization Therapies Directed at Helicobacter pyloriRita S. Santos; George R. Dakwar; Ranhua Xiong; Katrien Forier; Katrien Remaut; Stephan Stremersch; Nuno Guimarães; Sílvia Fontenete; Jesper Wengel; Marina Leite; Céu Figueiredo; Stefaan C. De Smedt; Kevin Braeckmans; Nuno F. AzevedoArtigo em Revista Científica Internacional
2014Emergent bacteria in cystic fibrosis: In vitro biofilm formation and resilience under variable oxygen conditionsSusana P. Lopes; Nuno F. Azevedo; Maria O. PereiraArtigo em Revista Científica Internacional
2015Enabling systematic, harmonised and large-scale biofilms data computation: The Biofilms Experiment WorkbenchGael Pérez Rodríguez; Daniel Glez Peña; Nuno F. Azevedo; Maria Olívia Pereira; Fiorentino Fdez Riverola; Anália LourencoArtigo em Revista Científica Internacional
2012Environmental factors influencing molinate biodegradation by a two-member mixed culture in rice paddy field floodwaterLuísa Barreiros; Joana Peres; Nuno F. Azevedo; Célia M. Manaia; Olga C. NunesArtigo em Revista Científica Internacional
2018Identification of pathogenic bacteria in complex samples using a smartphone based fluorescence microscopeVilhelm Mullër; José M. Sousa; Hatice Ceylan Koydemir; Muhammed Veli; Derek Tseng; Laura Cerqueira; Aydogan Ozcan; Nuno F. Azevedo; Fredrik WesterlundArtigo em Revista Científica Internacional